Eski Ege Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Mustafa Cüneyt Hoşcoşkun, tedavi için Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'ne başvurduğu sırada 3 Temmuz tarihinde gözaltına alındı. Yaklaşık 2 hafta süren tedavi sürecinin ardından emniyet işlemleri tamamlandı ve Hoşcoşkun adliyeye sevk edildi.
Cumhuriyet savcısı tarafından sorgulanan Hoşcoşkun, anlatımlarının etkin pişmanlık kapsamında yeterli görülmemesi ve firari olması sebebiyle tutuklanması talebiyle sulh ceza hakimliğine sevk edildi. Hakimlik, yeniden ifadesini aldığı Hoşcoşkun'un "FETÖ silahlı terör örgütü üyeliği" suçundan tutuklanmasına karar verdi.
Ege Üniversitesi'ndeki rektörlük görevinden Yükseköğretim Kurulu tarafından 28 Şubat 2017'de açığa alınan Hoşcoşkun, daha sonra 25 Ağustos'taki Kanun Hükmünde Kararname ile meslekten ihraç edilmişti. 11 Eylül 2017'de ise Hoşcoşkun hakkında FETÖ soruşturması kapsamında yakalama kararı çıkarılmıştı.
